Wiadomości

Pragniemy poinformować, iż przywróciliśmy formularz zgłaszania abstraktów. Na tym etapie można zgłaszać tylko plakaty.
LINK
We wish to inform that we have restored the abstract submission form. At this stage only posters can be submitted.
LINK
The course on big data for life sciences will be held in Uppsala, from 18th to 22nd September 2017. 

The detailed programme is under construction, the topics to be covered include: 
  • Introduction to Big Data
  • BIG Data Cloud solutions in Life in Life Sciences
  • NoSQL databases with a focus on MongoDB
  • Distributed storage and computing with Apache Hadoop
  • Large scale data-processing with Apache Spark
  • Machine learning with R
  • Metabolomics
  • Image analysis
 
The training course has a limited participation of 25 students.
A scientific committee will make a selection based on a letter of motivation written by the ...
Czytaj więcej
Do konkursu zgłoszono 11 prac. Każda praca została oceniona przez dwóch recenzentów. 
Zwycięzcą konkursu, została pani Melania Nowicka autorka pracy "Optymalizacja użycia par kodonów w projektowaniu syntetycznych otwartych ramek odczytu" obronionej na Wydziale Informatyki Politechniki Poznańskiej. Promotorem pracy był dr inż. Marcin Radom z Instytutu Informatyki Politechniki Poznańskiej. 

Dwa wyróżnienia otrzymali:
  • pani Anita Dudek, autorka pracy "Dokładność metody Poissona-Boltzmanna w obliczeniach energii swobodnej hydratacji białek", obronionej na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego, promotor dr Piotr Setny, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego
  • pan Piotr Żurkowski, autor pracy "DNA de novo assembly algorithm with repetition sensitive graph traversal", obronionej na Wydziale Informatyki ...
Czytaj więcej
Do konkursu zgłoszono 6 prac. Każda praca została oceniona przez dwóch recenzentów. 
Zwycięzcą konkursu, za pracę "Metody  teoretyczne przewidywania struktury białek oraz ich kompleksów z peptydami", obronioną na Wydziale Chemii Uniwersytetu Warszawskiego, został 

dr Maciej Błaszczyk (Wydział Chemii UW). 

Promotorami pracy byli : prof. dr hab. Andrzej Koliński i dr hab. Sebastian Kmiecik.
Serdeczne gratulacje dla zwycięzcy. 

Konkurs został przeprowadzony przez Komisję Konkursową w składzie: 
  • prof. dr hab. inż. Marta Kasprzak − Politechnika Poznańska (przewodnicząca) 
  • prof. dr hab. Anna Gambin − Uniwersytet Warszawski
  • prof. dr hab. inż. Andrzej Polański − Politechnika Śląska
Czytaj więcej
W rozstrzygniętych właśnie konkursach grantowych NCN duże sukcesy osiągnęli reprezentanci naszego środowiska - aktywni, nieaktywni i (mam nadzieję) przyszli członkowie PTBI. 
W konkursie OPUS granty otrzymali: 
  1. dr Michał Boniecki na projekt "Gruboziarnista metoda do modelowania struktury przestrzennej cząsteczek RNA, uwzględniająca niekanoniczne parowania zasad" (Panel ST6 - pierwsze miejsce na liście rankingowej). 
  2. dr hab. Marta Szachniuk na projekt "RNApolis - metody i algorytmy do modelowania i analizy struktury RNA" (ST6). 
  3. dr inż. Krzysztof Puszyński "Efektywne algorytmy symulacji modeli procesów stochastycznych w biologii obliczeniowej oraz metody syntezy modeli szlaków sygnałowych" (ST-6). 
  4. prof. dr hab. Wiesław Nowak na projekt "Strukturalne determinanty ...
Czytaj więcej
International meeting on Computational Approaches in Precision Medicine will take place at 27-28 July in Vienna.

The meeting will feature topical contributions from the US FDA as well as key players from the US (Yale, Harvard, …), Asia (Shanghai), and Europe. Locally, the meeting will host Christoph Bock from the CeMM in Vienna, who is this year receiving the ISCB Overton Prize for his work in epigenomics. Also Sepp Hochreiter will join the meeting from the JKU in Linz, who has won fame as one of the early pioneers of Deep Learning. More information and a tentative agenda is available online ...
Czytaj więcej

NETTAB 2017 
Methods, tools & platforms for Personalized Medicine in the Big Data Era
16-18 October 2017, Palermo, Italy
CALL FOR ABSTRACTS FOR ORAL COMMUNICATIONS AND POSTERS

TOPICS
The special topic is "Methods, tools & platforms for Personalized Medicine in the Big Data Era", which includes:
Data management: Biomedical Big Data Management, Standards for Clinical and Genetic Data, Data Privacy and Security, Omics Data Integration, Biobanks
Data analysis: Omics Data analysis, Genetic Mutation Analysis, Biomarkers Discovery, NGS Data Analysis, Patient Information Analytics
Tools and Services: Clinical Genomics Services, Models for Clinic and Genetic Data ...
Czytaj więcej
The review covers coarse-grained protein models: their design, representation, energy functions and sampling of conformational space. The review paper focuses also on prospective applications of coarse-grained models including: protein structure prediction, modeling of dynamic processes, protein interactions and modeling of membrane proteins. Some of the most successful applications have been achieved by the combination of coarse-grained models with a wide range of computational techniques, including classical all-atom modeling and implementation of restraints derived from various sources of experimental data.

The figure below shows application ranges for molecular modeling at different resolutions: quantum, all-atom, coarse-grained, and mesoscale. The approximate ranges ...
Czytaj więcej

Wiadomości

Wydarzenia

Konkurs na najlepszą pracę doktorską z bioinformatyki obronioną w 2016.

PTBI ogłasza konkurs na najlepszą pracę doktorską obronioną w 2016 roku. Do Konkursu mogą zostać zgłoszone prace doktorskie przygotowane na polskich wyższych uczelniach i w instytutach naukowych, obronione w Polsce między 1 stycznia a 31 grudnia 2016 roku. Praca może być zgłoszona przez autora lub promotora działającego w porozumieniu z autorem (nagrodę otrzymuje autor). Termin zgłoszenia upływa 15 marca 2017 roku.

Konkurs na najlepszą pracę magisterską z bioinformatyki obronioną w 2016.

Do Konkursu mogą zostać zgłoszone prace magisterskie przygotowane na polskich wyższych uczelniach i w instytutach naukowych, obronione w Polsce między 1 stycznia a 31 grudnia 2016 r. Praca może być zgłoszona przez autora lub promotora działającego w porozumieniu z autorem (nagrodę otrzymuje autor). Termin zgłoszenia upływa 15 marca 2017 roku.

#NGSchool2017: Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis

Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis (#NGSchool2017) is series of lectures and workshops, covering various aspects of Computational Biology, focusing on state-of-the-art techniques related to Next-Generation Sequencing (NGS) and its application in research, health-care and industry. It is mainly addressed to students and researchers in early stage of their careers. Nevertheless, we invite also more advanced researchers to apply. In 2017, we'll focus on data analysis from single-cell technologies. As before, the course will cover wide range of topics, selected by popularity among attendees. Example topics include:

X Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego

X Sympozjum PTBI odbędzie się w dniach 27-29 września w Uniejowie. Zapraszamy wszystkich członków i sympatyków PTBI do wzięcia udziału w jubileuszowym wydaniu naszego sympozjum. Więcej informacji na <a href="http://ptbi2017.cs.put.poznan.pl/">stronie sympozjum</a>. <p> 10-th Symposium of the Polish Bioinformatics Society will take place on September 27-29 in Uniejów. We cordially invite all PBS members and fans to participate. For more information see <a href="http://ptbi2017.cs.put.poznan.pl/">Symposium pages</a>

Linki

Statut

Protokoły

Zapisy

Archiwum

Bioinformatorek

Konferencje

Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej

International Society for Computational Biology

Nasz profil na LinkedIn

Nasz profil na Facebook-u