Polish Bioinformatics Society

Komitet Naukowy i Prelegenci

Prof. dr hab. inż. Małgorzata Kotulska 
Wybitna ekspertka w dziedzinie inżynierii biomedycznej, biofizyki oraz bioinformatyki związana z Politechniką Wrocławską. Prowadzi rozbudowaną działalność badawczą skupioną wokół zjawiska elektroporacji, symulacji molekularnych kanałów jonowych oraz agregacji białek amyloidowych odpowiedzialnych za choroby neurodegeneracyjne. Jej wieloletnie doświadczenie pozwala na nowatorskie łączenie biologii strukturalnej z zaawansowaną analityką informatyczną. Aktywnie wspiera rozwój młodych talentów jako opiekunka naukowa Koła Naukowego BioNanopor. Podczas tegorecznego wystąpienia przybliży uczestnikom nowoczesne metody modelowania oraz zaawansowanej analizy systemów biologicznych.

Dr hab. n. wet. Waldemar Grzegorzewski, prof. UR 
Profesor z Uniwersytetu Rzeszowskiego oraz uznany w świecie nauki ekspert z zakresu farmakologii, biotechnologii i biologii rozrodu. Jego imponujący dorobek naukowy obejmuje kierowanie licznymi projektami krajowymi oraz międzynarodowymi, a także wieloletnią pracę w instytutach Polskiej Akademii Nauk. W swojej działalności badawczej specjalizuje się w molekularnych procesach komórkowych oraz integracji sygnałów endokrynnych. Aktywnie poszukuje nowych, innowacyjnych strategii wspomagających rozwój współczesnej farmakoterapii i medycyny personalizowanej. W trakcie nadchodzącej edycji zaprezentuje wykorzystanie nowoczesnej analityki w głębokim zrozumieniu skomplikowanych mechanizmów komórkowych.

Dr hab. inż. Andrzej Mizera
Pracownik naukowy Uniwersytetu Warszawskiego oraz lider zespołu badawczego w renomowanym centrum IDEAS NCBR. Specjalizuje się w biologii systemowej, analizie sieci złożonych oraz matematycznym modelowaniu układów genowych. W swoich innowacyjnych projektach badawczych z powodzeniem wykorzystuje algorytmy sztucznej inteligencji i uczenia ze wzmocnieniem do reprogramowania komórek. Jego nowatorskie prace mają fundamentalne znaczenie dla opracowywania nowoczesnych terapii wymierzonych w schorzenia neurodegeneracyjne, w tym chorobę Parkinsona. Podczas tegorecznej konferencji szczegółowo omówi zaawansowane metody obliczeniowe służące do precyzyjnego sterowania dużymi modelami boolowskimi.

Dr Wanda Niemyska
Reprezentuje Uniwersytet Warszawski, a w swojej pracy naukowo-badawczej w wysoce innowacyjny sposób łączy matematykę wyższą z biologią strukturalną. Specjalizuje się w zastosowaniu zaawansowanych narzędzi topologicznych oraz teorii węzłów do dogłębnej analizy skomplikowanych i splątanych łańcuchów białkowych oraz kwasów nukleinowych. Jest współautorką kilkunastu prestiżowych prac naukowych oraz współtwórczynią internetowych baz danych i serwerów obliczeniowych, takich jak KnotProt czy AlphaKnot. Niedawno dokonała przełomowego odkrycia pierwszych węzłów w strukturach cząsteczek RNA. W swojej codziennej pracy z pasją udowadnia, jak teoretyczne koncepcje matematyczne i biologiczne mogą wzajemnie stymulować swój rozwój.

Dr Aleksandra Kalitnik
Badaczka z Katedry Inżynierii Biomedycznej Politechniki Wrocławskiej, specjalizująca się w chemii bioorganicznej oraz biofizyce obliczeniowej. W swojej działalności naukowej koncentruje się na procesach agregacji amyloidów, zjawisku cross-seedingu oraz skomplikowanych oddziaływaniach białko-białko. W badaniach mechanizmów powstawania struktur amyloidowych z powodzeniem wykorzystuje zaawansowane metody spektroskopowe, mikroskopowe i techniki optyczne. Ściśle współpracuje z zespołami bioinformatycznymi, wspierając analizę danych eksperymentalnych poprzez symulacje dynamiki molekularnej. Wcześniej z sukcesami badała budowę oraz immunomodulujące i przeciwnowotworowe właściwości naturalnych polisacharydów morskich.

Oliwia Polańska
Doktorantka w Katedrze Inżynierii Biomedycznej Politechniki Wrocławskiej, prowadząca badania pod kierunkiem wybitnych specjalistów. Jej codzienna działalność naukowa skupia się wokół zaawansowanych obliczeń in silico oraz strukturalnej analizy białek i peptydów. W swojej pracy bada właściwości agregacyjne białka Hpn wydzielanego przez Helicobacter pylori oraz jego interakcje z amyloidami odpowiedzialnymi za schorzenia neurodegeneracyjne. W laboratoriach wykorzystuje zaawansowane techniki biofizyczne, w tym mikroskopię elektronową oraz spektroskopię FTIR i CD. Jest również niezwykle aktywną członkinią Koła Naukowego BioNanopor, gdzie rozwija interdyscyplinarne pasje na styku chemii, biotechnologii i inżynierii.

Julia Cieszko
Doktorantka na Politechnice Wrocławskiej, realizująca interdyscyplinarne badania na styku biologii, medycyny i technologii informatycznych. Jej zainteresowania zawodowe koncentrują się wokół bioinformatycznej analizy właściwości specyficznych białek amyloidowych oraz modelowania struktur białkowych. W swojej pracy naukowej zajmuje się badaniem relacji zachodzących między strukturą a funkcją makrocząsteczek, a także rozwojem metod oceny jakości modeli cyfrowych. Szczególne miejsce w jej badaniach zajmuje proteomika oraz analiza wpływu amyloidów bakteryjnych na procesy neurodegeneracyjne w kontekście osi jelitowo-mózgowej. Skutecznie wdraża rzetelną analitykę wielkich zbiorów danych do odczytywania skomplikowanych zachowań w układach komórkowych.

Mikołaj Kikolski 
Badacz reprezentujący Wydział Podstawowych Problemów Techniki Politechniki Wrocławskiej. Specjalizuje się w interdyscyplinarnych dziedzinach nauki łączących w sobie zaawansowaną fizykę, biologię molekularną oraz nowoczesną inżynierię biomedyczną. Jego codzienna praca badawcza koncentruje się na skutecznym zastosowaniu innowacyjnych narzędzi obliczeniowych i programistycznych. Opracowuje i optymalizuje zaawansowane modele numeryczne ukierunkowane na wsparcie nowoczesnych metod analitycznych wykorzystywanych w medycynie. Poprzez swoje analizy wspiera zespoły eksperymentalne w dokładniejszym interpretowaniu zjawisk zachodzących na poziomie komórkowym.

Maxime Kucharski 
Jest członkiem zespołu badawczo-rozwojowego w firmie Lipid Systems, gdzie aktywnie współtworzy międzynarodowy projekt REGeRNA. Inicjatywa ta skupia czołowe ośrodki z całej Europy w celu opracowania nowatorskich terapii genowych służących do regeneracji mięśnia sercowego po zawałach. W ramach tych prac odpowiada za optymalizację procesów wytwarzania nanocząstek lipidowych oraz walidację metod oceny enkapsulacji materiału genetycznego. Równolegle prowadzi działalność naukową na Politechnice Wrocławskiej, zajmując się biofizyką błon, ilościowym bioobrazowaniem oraz modelowaniem matematycznym transportu witaminy C. Dodatkowo pełni funkcję prezesa Koła Naukowego Micela, koordynując eksperymentalne i teoretyczne badania studenckie.

Dr Marcin Magnus 
Biolog obliczeniowy specjalizujący się w bioinformatyce strukturalnej oraz zaawansowanym modelowaniu cząsteczek RNA. W swojej pracy badawczej łączy metody obliczeniowe, takie jak uczenie maszynowe czy dynamika molekularna, z klasycznymi technikami biologii molekularnej. Stopień doktora uzyskał w Instytucie Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie, a cenne doświadczenie zdobywał na Uniwersytecie Stanforda, Uniwersytecie Warszawskim oraz Uniwersytecie Harvarda. Aktualnie przygotowuje się do objęcia kierownictwa nad prestiżowym Laboratorium Projektowania RNA i Terapeutyków w Centrum Nowych Technologii UW. Jego głównym celem naukowym jest przełożenie zaawansowanych modeli sztucznej inteligencji na praktyczne projektowanie nowoczesnych leków opartych na RNA.

Dr Gniewosz Drwięga
Posiada stopień doktora w dziedzinie neurobiologii systemowej uzyskany na Uniwersytecie Jagiellońskim, gdzie pracował również jako adiunkt. Posiada wieloletnie, bogate doświadczenie v przetwarzaniu i zaawansowanej analizie danych elektrofizjologicznych, anatomicznych oraz behawioralnych. W swojej karierze z powodzeniem rozwijał i wdrażał zaawansowane potoki głębokiego uczenia służące do automatycznego śledzenia ruchu zwierząt oraz analizy obrazowej nowotworów mysich. Obecnie realizuje staż podoktorski w centrum Sano, koncentrując się na automatycznej segmentacji obrazów medycznych z wykorzystaniem geometrycznego uczenia głębokiego. Prywatnie jest pasjonatem sportu, regularnie trenującym sporty walki w klubie Grappling Kraków.

Jakub Bogacz 
Dyplomowany inżynier inżynierii biomedycznej oraz ambitny student informatyki stosowanej w języku angielskim na Politechnice Wrocławskiej. W swojej działalności naukowej i zawodowej koncentruje się na zagadnieniach informatyki medycznej oraz inżynierii wiedzy w obszarze ochrony zdrowia. Obecnie bierze aktywny udział w prestiżowym projekcie zajmującym się wdrażaniem międzynarodowego słownika LOINC w polskiej diagnostyce laboratoryjnej. Jego zainteresowania obejmują architekturę medycznych systemów informatycznych, interoperacyjność danych, kliniczne systemy wsparcia decyzji oraz rozwiązania służące do zdalnego monitorowania pacjentów. Swoimi działaniami udowadnia, jak nowoczesne technologie IT mogą realnie podnieść jakość opieki nad pacjentem.

Roman Radomski 
Uznany ekspert w dziedzinie informatyki medycznej oraz interoperacyjności danych w sektorze ochrony zdrowia. Od 2017 roku z sukcesami pełni funkcję prezesa Polskiego Stowarzyszenia HL7, a od 2025 roku zasiada w zarządzie oraz pełni rolę skarbnika HL7 Europe. Jako partner zarządzający w firmie HIT Inn doradza podmiotom medycznym we wdrażaniu nowoczesnych systemów teleinformatycznych. Wchodzi również w skład Rady ds. Interoperacyjności działającej bezpośrednio przy Ministerstwie Zdrowia. Swoją bogatą wiedzą z zakresu zarządzania ryzykiem operacyjnym i bezpieczeństwa danych przez lata dzielił się jako wykładowca na wielu polskich uczelniach.

Dr Wojciech Jopek 
Absolwent Wydziału Mechanicznego Politechniki Wrocławskiej, silnie związanym z dolnośląskim środowiskiem naukowo-technicznym. Swoje pasje badawcze rozwija w obszarze inżynierii biomedycznej, realizując innowacyjny doktorat poświęcony zaawansowanej protetyce kończyny górnej. Może pochwalić się imponującym dorobkiem aplikacyjnym, będąc autorem szesnastu publikacji naukowych oraz aż dwudziestu pięciu patentów i zgłoszeń patentowych. W trakcie swojej kariery z sukcesem koordynował i realizował zaawansowane projekty badawczo-rozwojowe na styku nauki i przemysłu. Doświadczenie budował zarówno w krajowych jednostkach medycznych i badawczych, jak i podczas bliskiej współpracy z międzynarodowymi koncernami technologicznymi.

Sylwia Bożek 
Specjalistka ds. badań w Sano Centrum Medycyny Obliczeniowej w Krakowie, gdzie pracuje jako bioinformatyk w projektach klinicznych. W swojej pracy naukowej koncentruje się na profilowaniu mikrobiomu zatok przynosowych z wykorzystaniem nowoczesnego sekwencjonowania nanoporowego. Jest absolwentką bioinformatyki na Uniwersytecie Jagiellońskim, wyróżnioną prestiżową Nagrodą Rektora za wybitne osiągnięcia. Z wielkim zaangażowaniem działa na rzecz integracji polskiego środowiska naukowego jako Wiceprezes Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego. Na konferencję powraca w roli prelegentki, będąc wcześniej współzałożycielką Bioinformatics Community PL oraz organizatorką edycji BioMeeting 2025.

Filip Schymik 
W swojej pracy badawczej rozwija i wdraża zaawansowane metody obliczeniowe do wieloaspektowego badania ludzkiego mikrobiomu jelitowego. Jego codzienne zadania obejmują poszukiwanie białek o nieznanych dotąd funkcjach oraz prowadzenie wielkoskalowych predykcji strukturalnych z wykorzystaniem klastrów GPU. W budowanych modelach z powodzeniem wykorzystuje multimodalne grafy wiedzy, które zasilają zaawansowane, agentowe systemy sztucznej inteligencji. Głównym celem jego ambitnych badań jest stworzenie cyfrowego bliźniaka ludzkiego mikrobiomu, co pozwoli na precyzyjne zrozumienie molekularnych mechanizmów chorób. Wierzy, że połączenie wysokowydajnego oprogramowania z gigantycznymi zbiorami danych otworzy drogę do skutecznych, celowanych interwencji terapeutycznych.

Dr Tomasz Kościółek
Kierownik zespołu badawczego Genomiki Strukturalnej i Funkcjonalnej w Sano Centrum Medycyny Obliczeniowej w Krakowie oraz adiunkt na Wydziale Informatyki AGH. Pełni również funkcję dyrektora naukowego firmy onebiome, członka Akademii Młodych Uczonych PAN oraz członka zarządu Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego. Stopień doktora nauk biologicznych uzyskał na University College London, a prestiżowy staż podoktorski odbył na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Diego. W swoich zaawansowanych badaniach koncentruje się na rozwoju metod obliczeniowych i uczenia maszynowego w celu głębokiego zrozumienia ludzkiego mikrobiomu jelitowego. Jego zespół dąży do zbudowania zintegrowanego, wielopoziomowego zrozumienia mikrobiomu od genów aż po innowacyjne terapie.

Goście Specjalni

Dr hab. inż. Sebastian Kraszewski, prof. PWr
Jest profesorem Politechniki Wrocławskiej związanym z Wydziałem Podstawowych Problemów Techniki oraz Katedrą Inżynierii Biomedycznej. Specjalizuje się w zastosowaniach sztucznej inteligencji w medycynie, zaawansowanych metodach numerycznych oraz modelowaniu molekularnym struktur biologicznych. Jako Dyrektor Naukowy Naukowego Centrum Neuroinnowacji z sukcesem koordynuje interdyscyplinarne projekty z pogranicza neuronauki, psychologii i technologii cyfrowych. Pełni również funkcję przewodniczącego sekcji Zdrowie w Grupie Roboczej ds. Sztucznej Inteligencji przy Ministerstwie Cyfryzacji. Podczas konferencji przybliży słuchaczom kluczową rolę metod uczenia maszynowego i symulacji in silico w nowoczesnej inżynierii biomedycznej.

Dr inż. Marlena Gąsior-Głogowska
Uznana badaczka i dydaktyczka związana z Katedrą Inżynierii Biomedycznej Politechniki Wrocławskiej. W swojej interdyscyplinarnej pracy naukowej z powodzeniem łączy perspektywę biotechnologii, chemii, biofizyki oraz spektroskopii oscylacyjnej do rozwijania nowoczesnej diagnostyki medycznej. Jej badania koncentrują się na bezmarkerowej analizie struktur biologicznych, badaniu procesów agregacji białek oraz projektowaniu innowacyjnych biomateriałów. W 2026 roku została prestiżowo wyróżniona miejscem na ogólnokrajowej liście Top 100 Women in Biotech. Na naszej konferencji zaprezentuje, jak zaawansowane podejście interdyscyplinarne może realnie wspierać rozwój technologii medycznych przyszłości.

Organizatorzy:

Współorganizatorzy:

Partnerzy:

Patroni Medialni:

Uczestnicy: