Szczegóły wydarzenia

#NGSchool2017: Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis

Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis (#NGSchool2017) will be held on 10-17 September 2017 in CBiESJachranka 81 k/Warszawy. In the course of one week, the participants will attend the series of lectures and workshops, covering various aspects of Computational Biology, focusing on state-of-the-art techniques related to Next-Generation Sequencing (NGS) and its application in research, health-care and industry. It is mainly addressed to students and researchers in early stage of their careers. Nevertheless, we invite also more advanced researchers to apply. 

In 2017, we'll focus on data analysis from single-cell technologies. As before, the course will cover wide range of topics, selected by popularity among attendees. Example topics include:  

  • introduction to Linux and Bioinformatics focusing on NGS-related analyses
    • programming in R / Bioconductor, Python
    • data visualisation
  • general handling of NGS data
    • data formats (FastQ, SAM, BAM, VCF)
    • Quality Control
  • de novo genome & transcriptome assembly
    • dealing with heterozygous/polymorphic genomes
    • gene prediction and functional annotation
  • detection of SNPs & SVs (deletions, duplications, inversions, translocations)
    • prediction of functional effects of detected variants
  • RNA-seq & differential expression analyses
  • Epigenomics: bisulphite sequencing, ChIP-seq, ChIA-PET, ATAC-seq, Hi-C data analysis
  • applications of NGS in biomedicine
    • GWAS & integration of molecular data
    • personalised medicine
    • microbial genomics
  • low input & single-cell: sample preparation & data analysis

You will learn both, command-line (Linux) and online tools. People having no prior experience with Bioinformatics are welcome, but strong motivation is desired! 
Participants should bring their own laptops with Ubuntu installed! We will provide some toy examples, but we encourage you to bring your own datasets. 
The course will be held in English. 

For more info, visit our website: https://ngschool.eu/2017

Kiedy: 10 września 2017 - 17 września 2017
Gdzie: Jachranka 81 k/Warszawy


Wiadomości

Wydarzenia

Konkurs na najlepszą pracę doktorską z bioinformatyki obronioną w 2016.

PTBI ogłasza konkurs na najlepszą pracę doktorską obronioną w 2016 roku. Do Konkursu mogą zostać zgłoszone prace doktorskie przygotowane na polskich wyższych uczelniach i w instytutach naukowych, obronione w Polsce między 1 stycznia a 31 grudnia 2016 roku. Praca może być zgłoszona przez autora lub promotora działającego w porozumieniu z autorem (nagrodę otrzymuje autor). Termin zgłoszenia upływa 15 marca 2017 roku.

Konkurs na najlepszą pracę magisterską z bioinformatyki obronioną w 2016.

Do Konkursu mogą zostać zgłoszone prace magisterskie przygotowane na polskich wyższych uczelniach i w instytutach naukowych, obronione w Polsce między 1 stycznia a 31 grudnia 2016 r. Praca może być zgłoszona przez autora lub promotora działającego w porozumieniu z autorem (nagrodę otrzymuje autor). Termin zgłoszenia upływa 15 marca 2017 roku.

#NGSchool2017: Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis

Summer School in Bioinformatics & NGS Data Analysis (#NGSchool2017) is series of lectures and workshops, covering various aspects of Computational Biology, focusing on state-of-the-art techniques related to Next-Generation Sequencing (NGS) and its application in research, health-care and industry. It is mainly addressed to students and researchers in early stage of their careers. Nevertheless, we invite also more advanced researchers to apply. In 2017, we'll focus on data analysis from single-cell technologies. As before, the course will cover wide range of topics, selected by popularity among attendees. Example topics include:

X Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego

X Sympozjum PTBI odbędzie się w dniach 27-29 września w Uniejowie. Zapraszamy wszystkich członków i sympatyków PTBI do wzięcia udziału w jubileuszowym wydaniu naszego sympozjum. Więcej informacji na <a href="http://ptbi2017.cs.put.poznan.pl/">stronie sympozjum</a>. <p> 10-th Symposium of the Polish Bioinformatics Society will take place on September 27-29 in Uniejów. We cordially invite all PBS members and fans to participate. For more information see <a href="http://ptbi2017.cs.put.poznan.pl/">Symposium pages</a>

Linki

Statut

Protokoły

Zapisy

Archiwum

Bioinformatorek

Konferencje

Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej

International Society for Computational Biology

Nasz profil na LinkedIn

Nasz profil na Facebook-u